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Cómo quitar una segunda instalación de un sistema operativo Windows de una partición

Si comprueba que hay una segunda carpeta de Windows en la misma partición que la carpeta de Windows "operativa", siga estos pasos para quitar dicha carpeta de la partición y quitar la selección de inicio que aparece al iniciar el equipo.

Nota: como existen varias versiones de Microsoft Windows, es posible que los pasos siguientes no sean iguales en su equipo. Si es así, consulte la documentación del producto para completarlos.

Inicie el sistema operativo de Windows que desea mantener.
Para determinar la carpeta de Windows que desea mantener, haga clic en Inicio y en Ejecutar, escriba %windir% y haga clic en Aceptar. No olvide el nombre de la carpeta que se ha abierto. Esta carpeta puede ser, por ejemplo, C:Windows.

Nota: ésta es la carpeta de Windows "operativa". No elimine ni quite esta carpeta de la partición.
En Explorador de Windows, busque la carpeta de Windows que desea quitar.

Importante: asegúrese de que esta carpeta de Windows no es la que ha identificado como "operativa" en el paso 2.
Haga clic con el botón secundario del mouse (ratón) en la carpeta de Windows que desea eliminar y, a continuación, haga clic en Eliminar.
Haga clic en Sí para confirmar la eliminación de la carpeta.
Haga clic en Inicio, haga clic con el botón secundario del mouse en Mi PC y, después, haga clic en Propiedades.
En la ficha Opciones avanzadas, en Inicio y recuperación, haga clic en Configuración. Aparecerá el cuadro de diálogo Inicio y recuperación.
En Inicio del sistema, haga clic en Editar para modificar el archivo Boot.ini.

El archivo Boot.ini se abre en Bloc de notas y su contenido es similar al que se muestra a continuación:

[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional"
/fastdetect
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)WINDOWS.0="Microsoft Windows XP Home"
/fastdetect

En el menú Archivo de Bloc de notas, haga clic en Guardar como y, a continuación, guarde una copia de seguridad del archivo Boot.ini con el nombre Boot.old.
En el menú Archivo, haga clic en Salir para cerrar la copia de seguridad del archivo Boot.ini.
En el cuadro de diálogo Inicio y recuperación, en Inicio del sistema, haga clic en Editar para volver a abrir el archivo Boot.ini.
En la sección [boot loader] del archivo Boot.ini, identifique y elimine a continuación la línea de texto del sistema operativo Windows que desea eliminar. Por ejemplo, si la carpeta Windows que eliminó en el paso 4 correspondía al sistema operativo Microsoft Windows XP Home Edition, quite la siguiente línea de texto del archivo Boot.ini:

multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)WINDOWS.0="Microsoft Windows XP Home"
/fastdetect

En el menú Archivo, haga clic en Guardar para guardar los cambios realizados en el archivo Boot.ini.
En el menú Archivo, haga clic en Salir para cerrar el archivo Boot.ini.
Haga clic en Aceptar para cerrar el cuadro de diálogo Inicio y recuperación.
Reinicie el equipo.

*PD: Ir a la fuente esta mas ordenado.